冷冻式干燥机应安装在环境温度为2-45℃，四周通风良好，空气洁净的建筑物内；特别是避免空气中含有腐蚀类成份（如氨）。当室内机房通风条件不良时，需在机房内安装换气排风设备。开机前必须对压缩空气管道系统进行吹扫，以免杂物进入干燥机及过滤器影响使用。
方法：切断干燥净化设备的压缩空气入口阀门、出口阀，开启空气旁路阀门起动空压机，使气体走旁路半小时左右，以便吹扫。
也有一部分水雾在经过过滤器时被集中和除去。冷冻干燥机过滤器的主要作用是过滤压缩空气中的固体颗粒。从空压机出来的热而潮湿并含有水份的压缩空气首先经过空气对空气热交换器预冷却;然后经过预冷却的空气，在空气对冷媒热交换器被冷干机的冷冻剂循环回路进一步冷却，冷冻干燥就是将含水物质，先冻结成固态，而后使其中的水分从固态升华成气态，以除去水分而保存物质的方法。
进入21世纪，真空冻干技术凭借其它干燥方法无法比拟的优点，越来越受到人们的青睐，除了在、生物制品、食品、血液制品、活性物质领域得到广泛应用。滤芯一般主要用在油过滤、水过滤、空气过滤等过滤行业。除去过滤介质中少量杂质，可保护设备的正常工作或者空气的洁净，冷冻干燥机使用前，先将准备干燥的物品置于低温冰箱或液氮中，使物品完全冰冻结实，方可进行冷冻干燥。
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